花了點時間安住地方，楊肇基派兵繼續在附近搜捕軍，尤其是找尋李自的下落。同時楊肇基給京師那邊上了奏摺，仔細說了兵變之事，向朝廷請罪的同時也告訴朝廷，因為兵變緣故，他這邊沒辦法再派部隊勤王了。
接下來的幾日，陸陸續續又搜捕到了些逃散民間的軍，可始終都沒找到李自的下落。無奈之下，只能發出海捕文書，告知各州府繼續捉拿李自等人。
而這個時候，李自已經帶著他的兄弟們日夜兼程一口氣從金縣跑到了定西，為了避免被地方察覺，李自本就沒走道，行的都是小路或者人跡罕見的區域，他的目標依舊是老家陝西，不管怎麼說先跑到陝西再做打算。
李自在金縣殺上造反，甘肅勤王軍還沒走出甘肅呢就因為這場兵變煙消雲散。
而在京師，明軍和皇太極的八旗依舊在作戰，自從兩軍對壘後第一次手，袁崇煥設下陣法意圖引八旗兵反而被對方打了個落花流水，就連自己也差一點戰死當場，接著慌之中倉促開炮，非但沒有給八旗帶來什麼傷亡，反而誤擊了滿桂，不僅打死了近百友軍，就連滿桂也被自己人的火炮給打傷。
這一戰後，明軍計程車氣大跌，對八旗的畏懼更甚。雖然崇禎皇帝之後召袁崇煥和滿桂城，在表彰滿桂的同時也敲打了袁崇煥一番，可回到城外的袁崇煥卻沒有按照崇禎皇帝的旨意帶兵進攻八旗，反而擺出一副標準的守勢。
這倒不是袁崇煥不想打，而是他不敢打。作為薊遼督師，袁崇煥和八旗手多年，非常清楚這些建奴的戰鬥力有多強。雖然他帶來的關寧軍都是銳，除去他的部隊外，還有宣大的友軍，從人數來說並不比八旗兵，甚至還佔有優勢。
可袁崇煥卻清楚打仗不是僅僅看人數的，如果靠人數就能贏的話那麼遼東戰事也不會一直到今日未能平定了，建奴野戰的戰鬥力極強，再加上建奴的八旗兵和一同而來的蒙古人都是騎兵，僅靠自己手中這些軍隊如果僅僅防守絕對沒問題，可要野戰贏得對方連半分把握都沒。
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