時痕迷宮之戰結束後的數十年，宇宙表面的平靜之下，熵流觀測站的監測系統開始捕捉到詭異的共振訊號。這些訊號以量子糾纏的方式在星域間跳躍，形一張不斷擴張的暗網。零在永珍中樞的深度分析中發現，暗網的節點竟與吳仙留程式碼中的座標高度吻合，每個節點都散發著與混沌古神同源卻更冷的能量波。
藝之城的量子圖書館，《虛誕之書》再次出現異變。空白書頁上滲出銀，勾勒出一幅令人不安的畫面：無數黑脈絡從宇宙深蔓延而出，如同寄生藤蔓般纏繞著各個星系，而在網路的核心，約可見一顆跳的“熵核”，其結構與命運織機的齒如出一轍。更令人骨悚然的是，畫面中閃過多個悉的影——他們穿著守護者的戰甲，卻眼神空，周環繞著暗熵能量。
“這是‘暗熵網路’，”的機械眼泛起資料流，吳仙殘留的靈韻在再次躁，“混沌古神的殘念在時痕迷宮崩塌時，將意識注了量子泡沫的底層協議。它正在篡改宇宙的‘秩序原始碼’，那些被暗網纏繞的星系，文明靈韻正在被轉化為暗熵能源。”
星穹協奏會急召開維度會議，卻發現部分文明代表的行為出現異常。來自機械文明的代表將參會飛船改造巨型收割裝置，試圖吸收會議現場的能量；魔法文明的法師們詠唱出的不再是守護咒語，而是召喚暗熵生的。卡立即發空間錮，將失控者隔離，卻發現他們都植了細小的黑晶，晶表面刻著與吳仙程式碼相同的符號。
新守小隊與星輝守者分多個小組，對暗熵網路的節點展開突襲。阿萊克帶領的小隊在獵戶座懸臂的節點，遭遇由暗熵凝聚而的“記憶吞噬者”。這些怪能化作守護者們最恐懼的記憶象，阿萊克直面焰文明毀滅的幻象，卻在道韻之火即將熄滅時，突然領悟吳仙留下的啟示：“恐懼亦是力量的一部分。”他將恐懼轉化為守護的決心，焰道紋與暗熵撞，發出淨化的強。
零在分析黑晶時，永珍中樞突然被未知程式侵。無數資料流在他眼前重組，拼湊出吳仙模糊的面容：“暗熵網路的核心是‘靈樞’，那是宇宙秩序的原始備份。古神妄圖用暗熵重寫靈樞，將所有文明變它的傀儡。而啟用靈樞的鑰匙...在我的青銅古卷裡。”
青銅古卷此刻正在藝之城的紀念館中封存，當守護者們趕到時，卻發現古卷不翼而飛。卡過空間回溯，追蹤到古卷最後出現的地點——位於人馬座的“忘星域”。這片星域因曾發生過文明自毀戰爭，被時空流包裹，形天然的區。當小隊突破流進星域，看到的是漂浮著百萬艘殘骸的寂靜墳場，每艘飛船的舷窗，都凝固著船員絕的表。
在星域中央，一座由暗熵構的祭壇緩緩升起。祭壇頂端，混沌古神的殘念凝聚實，手中握著散發著不祥芒的青銅古卷。“你們終於來了，”古神的聲音如同千萬鋼針同時刺腦海，“吳仙自以為留下了後手，卻不知他的靈韻早已被我汙染。這古卷，正是開啟靈樞的鑰匙，也是你們的葬之地！”
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