熵能反應堆平穩執行的第三百年，宇宙邊緣的「寂靜深淵」突然泛起詭異的漣漪。這片曾被視為宇宙盡頭的虛空，竟開始規律地脈，彷彿某種沉睡的巨正在甦醒。零的永珍中樞監測到異常的量子汐，其波頻率與當年熵晶矩陣的核心頻率高度吻合，更令人不安的是，汐中夾雜著若有若無的暗熵韻律，如同古老的喪鐘在虛空中迴盪。
藝之城的先知們過「星語水晶」觀測到了前所未有的天象：無數星辰組巨大的齒狀陣列，在天幕中緩緩轉。水晶表面浮現出古老的預言：“熵再起，命運轉，當齒咬合的剎那，世界將迎來終焉與新生。”的量子共鳴琴自發震，琴絃上凝結出細小的冰晶，每冰晶都折出破碎的未來景象——文明在暗熵洪流中湮滅，守護者們的影支離破碎。
星穹協奏會急召開全宇宙峰會，機械文明展示的最新研究果令人震驚：“寂靜深淵的量子汐正在重塑宇宙的能量網路，暗熵粒子的濃度以幾何倍數增長。更可怕的是，這些粒子似乎有自我意識，正在選擇地侵蝕文明的核心科技。”零調出永珍中樞的深度分析報告，螢幕上的資料流勾勒出一幅恐怖的圖景——暗熵粒子如同病毒般侵各個文明的量子計算機，篡改著維繫文明運轉的底層程式碼。
新守小隊與靈韻學院的新生代守護者組「熵特遣隊」，攜帶由多元文明聯合研發的「熵能中和裝置」前往寂靜深淵。當他們的星艦接近深淵時，艦周圍的空間開始扭曲螺旋狀，所有導航系統失去作用。卡的空間知能力劇烈刺痛，他勉強維持著空間穩定：“這裡的空間結構被某種超維力量改寫，我們就像被困在巨大齒中的螻蟻！”
就在眾人陷困境時，吳仙的靈識以資料流的形態顯現。他的廓由金符文與暗紫熵能織而，手中託著一個不斷旋轉的微型齒：“寂靜深淵是宇宙命運齒的軸心，而暗熵汐是齒轉的潤油。混沌古神雖已消亡，但其設下的終局之局仍在運轉。”他將微型齒拋向特遣隊，齒化作萬千流融眾人的意識，“想要阻止齒咬合，必須找到散落在不同時空的「命運樞軸」。”
特遣隊循著吳仙的指引，踏被暗熵籠罩的時空裂隙。他們首先來到了「機械紀元」的平行時空，這裡的機械文明早已被暗熵同化，城市淪為由齒與暗熵晶組的鋼鐵墳場。守護者們遭遇了詭異的「齒傀儡」，這些傀儡的由機械與暗熵手構，每一次攻擊都帶著致命的時空切割力。艾琳發現，這些傀儡的行規律與星穹協奏會監測到的量子汐頻率一致，立即過靈韻通訊向隊友傳遞資訊：“它們的弱點在關節的熵能連線點！”
在激烈的戰鬥中，零破解了齒傀儡的控制程式碼，發現它們的核心指令竟是“加速命運齒的轉”。當特遣隊摧毀傀儡群的中樞控制時，一座由暗熵能量凝聚的巨型齒從地底升起，齒表面刻滿了混沌古神的詛咒符文。吳仙的靈識及時提醒：“這是第一個命運樞軸，用熵能中和裝置打它的運轉頻率！”
特遣隊默契配合，的歌聲化作音波鎖鏈纏繞齒，雷歐的焰道紋灼燒著符文，卡用空間扭曲擾齒的咬合，零則將熵能中和裝置嵌齒核心。在劇烈的能量撞中，齒發出刺耳的轟鳴，表面的符文逐漸崩解，最終停止轉。但特遣隊還未來得及鬆口氣，永珍中樞便傳來警報——其他時空的命運樞軸正在加速運轉，試圖彌補這裡的“缺失”。
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