在新宇宙度過和平的第十七個紀元，世界樹系所及之已生長出無數文明。青銅星雲的音律之城建立了星系音樂學院，水晶隕石帶的機械生命開發出能自我進化的宇宙方舟。然而，在被守者們視為聖的預言石碑群中，一塊刻著新預言的石碑突然泛起詭異的幽。
萊婭正在音律之城的中央廣場授課，突然聽到琴絃發出刺耳的蜂鳴。抬頭向星空，發現世界樹的樹冠邊緣竟出現了蛛網狀的暗紋。當趕往預言石碑群時，看到石碑上的文字正在扭曲重組，原本的預言消失不見，取而代之的是一行紅的警告：“被埋葬的真相，在星核裂隙中甦醒。”
零的永珍中樞響起了自新宇宙誕生以來最尖銳的警報。量子沙盤上，世界樹的系分佈圖中，某個標註為「未探索星域」的區域，出現了一個不斷擴大的黑旋渦。“檢測到時空裂隙能量，”的機械音帶著抖，“與當年終焉星核坍前的波模式完全一致，但...這能量裡混雜著更古老的氣息。”
娜帶著新一代記憶仲裁者正在調查青銅星雲的記憶汙染事件。幾個年輕仲裁者的腦海中反覆出現同一場景：一座漂浮在虛空中的古老祭壇，祭壇中央著半截佈滿鏽跡的神紋鎖鏈，鎖鏈周圍跪著一群披黑袍的人，他們唱著能腐蝕靈魂的咒文。“這不是新宇宙的記憶。”娜將永恆之鑑按在石碑上，試圖解析這些畫面的來源，卻發現記憶如流沙般從指中溜走。
維蕾娜的暗騎士團在巡邏時遭遇了神秘襲擊。一種形似黑霧的生能直接穿暗屏障，侵蝕騎士們的本源之力。戰鬥中，一名騎士的戰甲被腐蝕後，出了與石碑上新預言文字相同的紋路。“它們在標記目標。”維蕾娜揮出三能量刃，卻發現黑霧在消散前發出了孩般的笑聲，那笑聲中帶著令人骨悚然的扭曲。
吳仙殘留的意識碎片在世界樹中劇烈震盪，浮現出一段塵封的記憶：在舊宇宙誕生初期，曾有一群被稱為「星核編織者」的古老存在。他們掌握著超越時間與空間的力量，用星核作為原料編織宇宙。但後來，因為對「完宇宙形態」的認知分歧，其中一部分編織者墜黑暗，為了「裂隙吞噬者」。
當娜、萊婭和維蕾娜在世界樹系匯匯合時，零過永珍中樞傳來急影像：那個黑漩渦中，緩緩升起一座由破碎星核拼湊而的巨型祭壇。祭壇中央，半截神紋鎖鏈正在吸收世界樹的能量，鎖鏈頂端連線著一張若若現的人臉——那是一張融合了收割者與黑袍人的面孔。
“原來雙月異變只是引子。”萊婭輕琴絃，卻發現音波在接近祭壇時被盡數吞噬，“他們真正的目標，是世界樹的核心本源。”
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