維度裂隙閉合後的第三年，宇宙各仍殘留著不安的震。世界樹系末端的星域裡，時不時會出現紫的能量殘影，如同傷口癒合後的疤痕，作痛。零的永珍中樞持續於高度警戒狀態，量子沙盤上佈滿閃爍的紅點，標記著那些尚未完全淨化的維度殘留能量。
萊婭在世界樹的「音律搖籃」中沉睡，的被髮的琴絃纏繞，構繭狀的保護屏障。每當世界樹的樹冠被微風吹拂，那些琴絃便會自震，奏出空靈而哀傷的曲調。音律之城的居民們聚集在搖籃下方，聆聽著這些無意識的旋律，試圖從中解讀出守護神的訊息。年輕的音律學徒艾莉尤其痴迷於此，每日都會帶著豎琴前來，嘗試模仿這些神秘音符，卻總是在某個節點出現刺耳的雜音。
維蕾娜在暗騎士團的基地中休養，的戰甲被維度黏腐蝕的孔仍未完全修復，每一裂痕都閃爍著詭異的紫。團最年輕的騎士凱斯每天都會為送來特製的能量藥劑，同時帶來宇宙各的報。“青銅星雲出現了記憶紊的現象，居民們開始混淆現實與夢境。”凱斯彙報時，維蕾娜的瞳孔微微收——記憶問題向來是娜的專長，可如今娜仍在深度昏迷中，躺在記憶仲裁者總部的「永恆夢境艙」裡。
娜的意識被困在記憶之海的深，周圍漂浮著無數破碎的記憶泡泡。這些泡泡裡不再是守者們的英勇時刻，而是充斥著黑袍人扭曲的面孔、維度裂隙中出的手，以及世界樹枯萎的畫面。的永恆之劍黯淡無，在記憶沙灘上，鏡面蒙著一層紫霧氣。記憶仲裁者們日夜守在艙室外，不斷將純淨的記憶能量注艙，試圖喚醒他們的領袖，卻收效甚微。
零在永珍中樞的核心實驗室裡，正專注地培育著三顆新的火種。暗金的培育艙中，音律火種呈現出水晶琴鍵的形態，表面流轉著彩虹的暈；闇火種如同魚般緩緩旋轉，與暗的能量在其中達微妙平衡；記憶火種則是一團不斷變幻的金雲霧，約能看到各種記憶場景在其中閃現。“你們將為新宇宙的免疫系統。”零輕聲說道，機械手指在控制面板上飛速敲擊，為火種注最後的防護程式。
然而，平靜的表象下暗流湧。在宇宙邊緣的「寂靜星域」，一艘由維度金屬打造的黑方舟正在悄然型。方舟表面佈滿與裂隙黏相同的紋路，船頭雕刻著巨大的眼睛，瞳孔中閃爍著對生命的漠視。方舟部，被同化的黑袍人們正在進行某種邪惡儀式，他們將捕獲的小型星系作為祭品，投巨大的熔爐中，熔爐中沸騰的紫，正是維度噬元的本源質。
艾莉在一次嘗試模仿萊婭的音律時，琴絃突然迸發出強烈的芒，將捲一個神秘空間。在那裡，見到了沉睡的萊婭意識投影。“孩子，你聽到了裂隙的殘響...”萊婭的聲音虛弱卻堅定，“那些雜音不是錯誤，而是指引。找到音律與維度頻率的共鳴點，才能阻止它們的復甦。”艾莉驚醒後，發現自己的豎琴上浮現出全新的符文，這些符文與世界樹系的紋路呼應。
與此同時，凱斯在執行巡邏任務時，遭遇了一群偽裝隕石的維度生。它們的攻擊方式與三年前的黏怪截然不同，能夠釋放出干擾暗能量的聲波。凱斯的戰甲在聲波衝擊下瀕臨崩潰，千鈞一髮之際，維蕾娜的影劃破星空而來。尚未完全恢復的三能量，與維度生的聲波撞，產生了意想不到的效果——能量波竟形了一個小型的維度旋渦，將敵人盡數吞噬。“原來...調和之力還能這樣用。”維蕾娜若有所思，眼神中重新燃起鬥志。
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