關於星海研究院的管理，除了最初立時架構各大部門以外，一直以來徐川都沒怎麼手。
雖然在溫遠航和四大研究所各自負責人的管理下，目前的運轉並沒有什麼問題，也備了一定的研發能力。
但若要是細挖，研究院整理的組織機構、管理制度、決策效率等方方面面都有著不的問題。
比如目前研究院分四大研究所，看似各司其職，還能互相配合，但實際上卻缺乏有效的組織架構和一致的管理戰略。
目前科研上的工作，四大研究院基本各自為戰，甚至細分到專案組部，對於研發過程中的一些稽核都比較的。
這導致了研究所各團隊或實驗室之間的工作重疊、資源浪費和優勢互補的機會被忽視，降低了整的工作效率和創新能力。
其次則是管理制度，現在的星海研究院管理方面基本都依賴人工，專案上需要什麼材料和零配件都需要研究員提後一層層的稽核，通過後再與對應的廠商對接。
這種稽核制度很常規，很多科研機構或者單位都在用。
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