時荏苒，轉眼間中忍考試已經過去了十二年。如今的大蛇丸，歲月在他的臉上留下了些許痕跡，他步了中年時期。然而，他的野心並未隨著時間的推移而消減，反而愈發膨脹。
在這十二年裡，大蛇丸一直在暗中謀劃著一個驚天地的計劃——木葉崩潰計劃。為了實現這個計劃，他與第四代風影·羅砂結盟，兩人決定聯手進攻木葉村，給這個曾經的敵人以致命一擊。
為了確保計劃的順利進行，大蛇丸派出了他的得力部下藥師兜，讓他偽裝一名普通的中忍考生，潛木葉村。而大蛇丸自己，則化為一名來自草村的中忍考生，巧妙地混了木葉村。
在死亡森林中，大蛇丸與宇智波佐助不期而遇。大蛇丸一眼就看中了佐助那強大的潛力和復仇的決心，他深知佐助是一個絕佳的轉生容。於是，大蛇丸毫不猶豫地給了佐助天之咒印，並預言佐助將會為了報宇智波一族被滅族之仇，主來找他追求力量。
之後，大蛇丸趁羅砂不備，暗殺了第四代風影，並將自己偽裝風影的模樣。這樣一來，他便能夠完全掌控砂忍的行，使他們為自己實現木葉崩潰計劃的工。
終於，到了第三場中忍正式考試的日子。偽裝四代目風影的大蛇丸到了三代目火影的特別邀請，來到木葉村中忍選拔會場，與三代目火影一同觀賞這場淘汰賽。
在這期間，大蛇丸派出了他的四名得力部下——多由也、次郎坊、鬼丸和左近右近，讓他們偽裝兩名砂忍者擔任護衛。然而，宇智波佐助卻未能按時趕來參加考試，儘管三代火影多次推遲考試時間，佐助依然沒有出現。於是，三代火影決定取消佐助的考試資格。
就在這時，“四代目風影”出面勸阻，他表示佐助可能遇到了一些特殊況，建議再給佐助一些時間。三代火影考慮到與砂村的友好關係，最終打消了取消佐助資格的念頭。
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