萬宇聯合艦隊返航的第十天，本源基地正沉浸在勝利的喜悅中。宇宙共生聯盟的九大文明代表齊聚基地廣場，為犧牲的戰士舉行悼念儀式，同時慶祝萬宇共生陣的全面穩定——如今，所有平行宇宙的脈已過能量紐帶相連，林夏化作的“萬宇共生之靈”，正以本源之心核心碎片為樞紐，即時調節著宇宙的能量平衡。
然而，這份平靜被一則急警報打破：“暗能綠洲出現異常能量波！”監測工程師的聲音帶著慌，全息螢幕上，原本生機盎然的暗能綠洲，部分割槽域泛起詭異的暗紫，脈被一種未知的變異能量侵蝕，呈現出扭曲的黑紋路，“檢測到噬能巨的基因片段！它們在暗能流的滋養下發生變異，形了‘噬能孢子’，正在快速擴散！”
華宇立刻調閱詳細資料，臉驟變：“這些孢子能寄生在脈中，吸收平衡能量後快速繁，還能染生，將其轉化為‘變異噬能’！暗能綠洲的三座臨時能量補給站，已經失去了聯絡，大機率已被孢子染！”
林夏的金能量虛影出現在螢幕旁，眼中閃爍著凝重的芒：“噬能巨的基因片段帶有強烈的侵蝕，萬宇共生陣的淨化能量暫時無法覆蓋暗能綠洲的所有區域。如果不盡快清除孢子，變異噬能將蔓延至整個本源宇宙，甚至過萬宇共生陣擴散到其他平行宇宙！”
聯盟議會急啟應急方案，華宇率領“共生號”旗艦與星核、星環文明的英艦隊，再次前往暗能綠洲。當艦隊抵達目的地時，眼前的景象令人心驚：曾經的能量綠洲已淪為變異之地，地面上覆蓋著暗紫的菌毯，扭曲的黑脈從菌毯中出，無數只形態怪異的變異噬能在綠洲中游——它們有的是被染的掠奪者殘兵，有的是變異的原生生，表佈滿噬能孢子，散發著狂暴的暗紫能量。
“啟‘孢子隔離場’！”華宇下令，星核艦隊釋放出紫金晶，在綠洲外圍搭建起巨大的能量屏障，將變異區域與外界隔離，“星環小隊，組突擊梯隊，清理外圍的變異噬能；晶元機械師，釋放探測機人，收集噬能孢子的樣本，分析其變異特！”
星環文明的星甲戰士駕駛著戰機，朝著變異噬能發起攻擊。星甲合金的能量炮擊中噬能後，對方的軀雖會暫時崩裂，但散落的孢子很快又會聚集，重新形新的噬能。“它們的再生能力太強了！普通攻擊本無法徹底消滅！”星環小隊隊長的聲音帶著焦急。
晶元機械師的探測機人功收集到孢子樣本，即時傳輸給“共生號”的分析中心。林夏的能量虛影快速解析資料：“噬能孢子的變異基因中，既有噬能者的吸收特，又融合了暗能流的狂暴能量。要徹底消滅它們，必須用‘金墨淨化火’——將平衡能量與混沌能量按特定比例混合，形的高溫火焰能焚燒孢子，同時不破壞脈的基。”
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