因為要想辦法黑日本的戶籍系統，高遠這些天研究過這時代最前沿的網路攻擊和防技，但比起自己研究生期間學習過的穿越前那個世界的技水平落後太多，因此，高遠自認這個世界的駭客手段應該沒有強到連自己都無法招架的程度。
可是現在的況，卻完全超出了自己的掌控，一個自己沒有發現無法阻止的病毒，正在對伺服主電腦的資料進行徹底的刪除——面對這個狀況，結合這個《名偵探柯南》的世界，“暗夜男爵病毒”，這個名字自然而然的閃現在自己腦海裡。
這種病毒第一次被提及是在《暗夜男爵殺人事件》中。
傳說這是一種虛幻的電腦病毒，慢慢侵各大企業的電腦裡進行破壞，是一個工程師本無從發現也無從阻止的完程式。也因為這個病毒簡直是神出鬼沒，所以就將這個病毒起名“暗夜男爵”！
活的組織者提出要以“暗夜男爵”作為獎勵給參加活的優勝者。但破案後眾人才發現組織者手中並沒有這種病毒，只是希以此為餌釣出被害人將其殺害，認為這種病毒也僅僅是傳說罷了。
可是在後來，該病毒確實的在宮野志保變小後出現。當灰原哀使用阿笠博士、柯南和本人共同找回的含黑組織全部人員、藥品等相關資料的資料磁碟時，由於灰原著急開啟，疏忽之下，忘記了組織給所有磁盤裡安裝此病毒的事實。
因此資料在開啟不久就全部消失。
其原因是該磁碟沒有在組織部的電腦中執行，因此激發該磁碟中的病毒，故包含阿笠博士電腦中及磁盤裡的所有資料均被銷燬。
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