在資源星球上，經過一番激烈的戰鬥，聯盟艦隊終於逐漸佔據了上風。不明勢力的戰艦開始出現損傷，他們似乎意識到繼續戰鬥下去只有死路一條，於是開始嘗試突圍逃跑。聯盟艦隊指揮下令：“不要放過他們，務必將這些襲擊者一網打盡！”艦隊追擊，不給襲擊者任何逃的機會。
然而，就在聯盟艦隊以為勝券在握的時候，意外發生了。一艘藏在暗的神秘戰艦突然出現，向聯盟艦隊發了猛烈攻擊。聯盟艦隊毫無防備，頓時陷混。那艘神秘戰艦的火力極其強大，一道道高能束來，聯盟艦隊的能量護盾紛紛破裂。
裴聰在指揮中心看到這一幕，心中大驚。他立刻說道：“快，分析那艘神秘戰艦的型號和來源。同時，命令艦隊不要慌，重新組織防。”可還沒等他說完，通訊頻道里傳來了資源星球艦隊指揮焦急的聲音：“裴聰，況不妙，我們遭到了未知戰艦的攻擊，損失慘重。”裴聰握拳頭，他知道，聯盟面臨的危機越來越嚴重了。
在科研基地，科研人員們還在為解決能源晶的問題而努力。莉莉安看著眼前的困境，心急如焚。突然，靈一閃：“或許我們可以嘗試用一種新型的能量轉換裝置，將現有的能源晶進行提純，雖然不能完全滿足實驗需求，但應該能讓實驗繼續下去。”說罷，立刻帶領科研人員開始手改裝裝置。
時間一分一秒地過去，各個戰場的局勢都十分張。藏勢力雖然大部分證據已銷燬，但仍在負隅頑抗；資源星球上，聯盟艦隊在神秘戰艦的攻擊下苦苦支撐；超級武的研發也因為能源晶的問題懸而未決。裴聰站在指揮中心，看著眼前的一切，心中暗暗發誓，無論如何，他都要帶領聯盟度過這次難關。
在資源星球的太空中，聯盟艦隊與神秘戰艦的戰鬥愈發激烈。神秘戰艦的攻擊如狂風暴雨般襲來，聯盟艦隊的戰艦不斷到損傷。一些戰艦的外殼被高能束擊穿，部燃起熊熊大火。可聯盟艦隊計程車兵們沒有退，他們頑強地抵抗著。
就在這時，通訊頻道里傳來了好訊息。反抗軍的支援部隊終於趕到了藏勢力所在的星球。特別行小組見狀，士氣大振。他們與反抗軍裡應外合，對藏勢力發了最後的總攻。藏勢力在兩面夾擊下，終於漸漸抵擋不住，開始節節敗退。
裴聰在指揮中心看到這一幕，心中稍微鬆了一口氣。但他知道，危機並沒有解除。資源星球上的神秘戰艦還在肆，超級武的研發也還沒有完。而且，外星文明隨時可能發大規模進攻，終極科技霸權集團也在一旁虎視眈眈。
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