滅世者出手可以將新的世界觀打這個世界時的劇本是什麼他不知道，可現在滅世者被封在了世界之門，他只要按照劇救世，滅世不死也要重傷。
滅世者改變人類的起源讓每一個人都為扣毀滅的扳機軀殼是想和他戰鬥到底，卻沒有料到自己會被封印。
五層的神的力量也出乎他意料，那種如果能積累夠信仰力量，連通上下兩層其實如同回家一樣輕鬆的能力不止滅世者，似乎其他創造主也不知道。
叮咚咚咚……
“那個上課了，我們下次再聊！”
碇真嗣逃一樣回到了自己的坐位，奉風一臉失的收拾照片，知道碇真嗣大概不會來煩他了。
此時六層殘墟和門在大量灰霧中消失的原址，為了尋找一同消失的人。
為了探明第二次衝擊的力量真相，在奉風留下的痕跡的廢墟之地灰柱的支柱下方，確定了灰霧能擋住衝擊餘波後，新的研究所開始建立。
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