藍星文明加宇宙防聯盟後，“生態修復計劃”在聯盟星域全面鋪開。藍星的技團隊帶著特製的“生態種子”，先後前往被蝕族汙染的死寂星區、被骨刺族破壞的破碎星區——這些種子在星核能量的滋養下，能快速生長出適應星際環境的“星植”，不僅能淨化殘留的有害能量，還能為星域提供穩定的生態迴圈。
這天，雲航與藍星文明的生態專家一同來到死寂星區。曾經漆黑的虛空，如今已點綴著淡綠的星植藤蔓，藤蔓上綻放的藍花朵不斷釋放著純淨的氧氣，吸引了不星際生在此棲息。“按照這個速度，不出半年，死寂星區就能恢復適合居住的‘新生星區’。”生態專家看著監測儀上的生態資料，臉上滿是欣。
就在這時，宇宙防總部傳來急通訊——藍星文明的母星，突然監測到大量虛空能量波，且波軌跡正朝著聯盟星域的方向移。“是之前逃的虛空族殘部！他們在集結力量，準備報復聯盟！”雲航臉驟變，立刻帶領艦隊返回總部。
總部的全息投影屏上，虛空能量的擴散圖譜清晰可見：一支龐大的虛空艦隊正從藍星母星外側的時空裂隙中駛出，艦隊規模是之前的十倍，旗艦上還掛載著一顆巨大的“虛空炸彈”，一旦引，足以摧毀整個宇宙能量網路的核心節點。
“必須在他們抵達聯盟星域前攔截！”雲航立刻制定作戰計劃：藍星文明的艦隊負責正面牽制，利用生態種子釋放的“能量屏障”阻擋虛空炸彈；星雲聯邦的艦隊啟螺旋導航儀，繞到虛空艦隊側翼，破壞其引擎系統；星塵航道與其他文明的艦隊組“核心突擊隊”，直撲虛空旗艦，摧毀虛空炸彈與能量核心。
作戰命令下達後，聯盟艦隊迅速集結，過宇宙能量網路的超時空節點，在“迷霧星域”設下埋伏。當虛空艦隊駛埋伏圈時，藍星艦隊率先發攻擊，無數顆生態種子在星空中炸開，形一道淡綠的能量屏障，將虛空艦隊牢牢困住。
虛空族首領見狀，立刻下令引虛空炸彈。危急時刻，星雲聯邦的艦隊突然從側翼殺出，螺旋能量炮準擊中炸彈的引裝置，讓炸彈陷休眠。“就是現在！”雲航帶領核心突擊隊衝向旗艦，銀藍的劍與各文明的攻擊織，瞬間突破旗艦的防層。
衝進旗艦部，雲航發現虛空族竟在利用捕獲的星際生，為虛空炸彈充能。“住手！”雲航一劍斬斷能量管線，救下了被困的生。虛空族首領惱怒，凝聚全虛空能量，化作一道黑巨爪，向雲航拍來。
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