瓊州大捷的訊息，如同上了翅膀，以八百里加急的速度傳遍南北，更隨著往來商船，遠播東西二洋。
北京，朝野震，一片歡騰。先前對南洋戰略有所質疑的聲音，在鐵一般的戰果面前，徹底煙消雲散。兵部尚書王在晉在朝會上昂首，細數戰功，力主加大對水師的投。原本持重的首輔韓爌，也上表稱讚皇帝聖明，水師將士用命，認為當藉此良機，徹底肅清南洋頑敵。
朱由校雖心中亦喜，但面上依舊平靜，下旨厚賞施大瑄以下所有有功將士，優恤陣亡者家屬，並令兵部、戶部議定南洋水師後續擴編及基地建設方案。同時，他再次強調《大明海疆律例》，要求水師在追擊殘敵、擴大戰果時，需謹守法度，不得濫殺，以收服人心為主。
太子的反應則更為複雜。他為前線大勝到由衷高興，但也從戰報的隻言片語中，到了海戰的殘酷與巨大的消耗。他更加努力地投到“仁政”的實踐中，督促戶部妥善安排卹，協調各地保障軍需資的供應，試圖以更好的政來支撐外部的開拓。
而在南洋，這場海戰的餘波更是引發了連鎖反應。
達維亞陷了前所未有的恐慌和沮喪。總督範·德林威信掃地，東印度公司部對他冒險與明朝開戰的政策怨聲載道。票在阿姆斯特丹易所暴跌，東們紛紛施，要求儘快與明朝談判，止損求生。荷蘭人不得不全面收防線，放棄了大量邊緣據點，集中力量守衛達維亞等核心區域，往日橫行南洋的氣焰然無存。
馬尼拉的西班牙人同樣膽寒。阿庫尼亞將失敗歸咎於荷蘭人的無能，西荷之間那脆弱的聯盟名存實亡。西班牙人開始認真考慮，是否要繞過荷蘭，單獨與明朝接，試圖挽回一些在呂宋的利益。
與此形鮮明對比的是，那些原本依附或畏懼荷西的南洋土著邦國，如亞齊、蘇祿、真臘，以及眾多蘇門答臘、婆羅洲的沿海土王，紛紛遣使前往瓊州或北京，進獻方，請求冊封，急切地希加強與天朝的關係。大明在南洋的威，如日中天。
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