此時的秦王李世民兼數職，威勢力直太子李建，功高震主難免被猜忌。平定後，李世民拒絕了奉命前來有非分之請的貴妃等人，秦王部屬又多次與後宮親屬產生。秦府上下對後宮已多有得罪。反之太子齊王與後宮妃嬪時常往來，經常聯合在高祖面前讒害李世民。眼見多次在外浴征戰的丈夫與皇帝疏遠，又為太子齊王所嫉，秦王妃直接出面緩和矛盾。常常在宮中出，孝順高祖李淵，同後宮妃嬪往，以彌補丈夫與皇帝的嫌隙，在後宮中為丈夫存留助力。在尚書右僕蕭瑀和太子保李綱等人的鼎力支援下，高祖李淵最終沒忍心對李世民下死手。秦王妃長孫氏等人同心影助為秦府的絕地反擊贏得了寶貴的備戰時間。正如歷史上無數次的皇權鬥爭一樣，兄弟反目終於決裂。
武德二年末因劉文靜事件，高祖已冰封過秦王。只因外戰事不斷，唐廷必須仰仗秦王武功，不得不在每次戰事吃時，一次復一次地啟用李世民，而事平之後對戰功越發顯赫的李世民猜忌更重。武德末期，皇帝猜忌日重，太子齊王日漸，李世民的境更加艱難。在武德七年六月楊文幹事件，秦府與太子齊王兩敗俱傷之後，雙方爭鬥進白熱化。
同年七月突厥再度寇邊，勢危急，太子齊王與多數大臣紛紛贊同遷都，唯獨李世民直諫，認為夷狄之患不足為懼，請求出征討伐突厥。高祖聽從了他的請求，但是太子與後宮妃嬪卻乘機進讒言誣陷李世民謀掌兵權以篡位。高祖再起疑心。之後高祖在城南狩獵，太子將一烈胡馬授予秦王妄圖摔死秦王，秦王馴馬後完好無傷答以“死生有命”，太子藉機令後宮妃嬪妄言“天命”誣陷秦王。高祖大怒，但礙於邊境不寧，缺不了李世民這軍事奇才，不得不按下此事。一計不再生一計，太子於東宮設宴用毒酒加害李世民，不。又和齊王策劃在昆明池暗殺李世民，並乘機宮。幸得率更丞王晊得知謀並將此事告知李世民。
經過一系列的事件，持續加劇著秦王府與東宮間的矛盾。秦王妃長孫氏沒有放棄彌。然而面對丈夫及其部屬遭遇的不公和打擊，長孫氏越發警醒地意識到擺困境的迫。此時的秦王妃長孫氏沒有退，義無反顧地站在丈夫後，和胞兄長孫無忌及房玄齡等秦王府僚共同給予丈夫毫無保留的支援。武德九年六月三日，金星再次白天出現在天空正南方的午位，當高祖將傅奕奏“秦王當擁有天下”告知李世民，於生死存亡之際的李世民下定了決心。
六月四日凌晨，李世民率領秦王府八百將士在玄武門設伏。通常站在丈夫後的長孫氏出人意料地出現在了丈夫旁，從容勉勵將士。將士們無不激秦王妃的親自勉，因此更發無畏。妻子無所畏懼地生死相隨不離不棄，更激勵著丈夫李世民。玄武門之變以秦王的完勝而告終。三天後的六月七日李世民被立為皇太子，長孫氏隨之為太子妃，八月八日李世民登基為帝，並在登基後十三天冊封長孫氏為皇后，從此明君賢后，相輝映。
長孫皇后喜看書籍圖傳，即便是梳妝打扮時也手不釋卷。為皇后後依然如此。經常與丈夫一起地共執書卷，談古論今，從容以對，發表獨特見解，對丈夫與朝政大有裨益。唐太宗對長孫皇后一向重。登基之後，對長孫家族常常恩遇逾制。
長孫皇后深以盈滿為誡，說服胞兄讓位，在太宗恩准下，長孫無忌得以閒職高薪退避宰執之位。長孫皇后還利用自對丈夫的影響力來護朝廷賢良，匡正丈夫的過失。長孫皇后一方面欣賞“庇護”著魏徵那些敢於直言的忠臣，另一方面也在不斷地提醒著李世民要行仁政。以特有的力量在男權至上的封建社會發揮著獨特的作用，輔佐皇帝丈夫，使得初唐出現了有利的政治局面。
君明後賢臣直，文治武功，春風和睦，親切包容。大唐初期迎來了它令後世魂縈夢繞的理想境界“貞觀之治”。
。復康及旋病后皇孫長，致所意誠子天是或，福祈子妻為宮藏曇師法寺普請好只宗太唐奈無，對反決堅的后皇孫長到遭但，允應即立宗太唐的慮憂康健子妻為，道人度並赦大求請子太皇。疾重染，間期暑避宮九在宗太同陪后皇孫長，年八觀貞
。效見不皆石藥，重加勢病，年次，疾氣的作發常時並患罹年早后皇孫長了發，痛哀的期喪重雙。擊打重沉次一又妻夫對這民世李和后皇孫長給，崩駕的淵李皇上太及以逝薨的人夫太國趙親母生的來而踵接後此，傷悲著線連卻後之悅喜而然。氏蘇妃納乾承李子太皇，年九觀貞
。顧眷次再有沒運幸，是但，運好來帶子妻給次一又夠能祉福的家佛待期宗太然雖。列此在便寺定修，寺寂善的名著，福祈后皇為座二十九百三寺古勝名下天復修詔下民世李，月四年十觀貞。家佛於助求次再定決宗太是於。願啟養供子妻為，珍名寶眾解並，師禪謁禮寺壁石到自親曾他，病生后皇孫長，原太幸駕宗太，年早
”。改不終，齊之與一“。相輔相政於，深儷伉於。載三十二了過走，持扶相互起一，髮結年從宗太與，生一的后皇孫長觀縱。陵昭為是，陵為山營，願后皇從遵，已不傷悲宗太。歲六十三年終，殿政立宮極太於逝崩后皇孫長，卯己月六年十觀貞
。怒之霆雷滅熄夫丈的上頭氣在讓能總，脾宗太諳深后皇孫長。宗太怒事小因常人之廷後。躁急免難氣脾，仗打軍行年長宗太。冤有人令故無不從，和平下后皇孫長
