地球—14512，這裡是潘妮。帕克所在的世界。
關注過《蜘蛛俠：平行宇宙》的朋友們應該知道，這個宇宙和《新世紀福音戰士》，也就是EVA的聯絡很深，時常會有使徒來襲。
此時，我們的14歲天才潘妮再次被特殊組織從課堂上走，不得不保護世界。
而教室裡，長相酷似碇真嗣。明日香。綾波麗。渚薰的同學們出了羨慕的表，他們也不想上課。
“哈哈哈......猜猜是誰找到了塵封於世界之外的最強兵——雷天使？沒錯！是我神秘客！彼得。帕克！我被你放逐了整整五年！現在是你償還一切的時候了！”
一個足有一棟樓高的巨大藍半明正八面，突然出現在城市上空。
隨之出現的，還有不斷瀰漫的霧氣。
人類的常規能武，難以突破雷天使堅固的外殼。破壞力足夠強大的能量武又會被神秘客的霧氣折，導致功效大減。
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