對於江南的那幫士紳異，朱由校其實沒太放在心上。自從上次想通之後，他整個人都著一壑然開朗的從容。
若有人真敢逆勢而為，他不介意行“理清君側”之實，憑手中鐵騎重定山河。
而在朝堂之上，經各方勢力角逐平衡，前參謀司的首批員名單終於定了下來，呈遞至朱由校面前請批。
名單之上，分別是兵部尚書熊廷弼；都察院左都史顧昭；戶部尚書畢自嚴；勳貴代表則毫無懸念，由德高重的英國公張維賢出任。
餘下六人，皆是從天樞、天策兩軍及衛軍中調的百戰老將，或者各軍參謀司的偏將，個個經百戰、功勳卓著。
這十人班子文武相濟、權責分明，其中系統出的參謀更逾半數，便於朱由校藉此牢牢掌控全國軍政。
為昭示對這個新機構的重視，他特旨於武英殿闢出專屬衙署，使其與閣所在的文淵閣遙相呼應。
此舉既明確定位了參謀司“軍機中樞”之責，亦暗含制衡文、強化皇權之深意，向朝野清淅傳遞出“文武並重、軍政合一”的革新訊號。
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