天都派派分為“外三殿、三堂、真傳五島七峰”。
外三殿指遇真宮正殿、傳度殿、掌籍殿，三殿位於巍嶼山。其中正殿為天一院管轄，傳度殿、掌籍殿為長老院管轄。
三堂指是執事堂、外事堂、執法堂，三堂於玉穹山。三堂由玉真、華、焰三峰執掌。
真傳五島，分別指博浪島丹鼎閣、烏風島煉閣、金沙島傳功閣、流雲島藏書閣、舟山島天工閣。
丹鼎閣、煉閣由掌教一脈天萊峰執掌，傳功閣、藏書閣、天工閣分別被天、霧幽、玉玄三峰執掌。
另外還有清庵山三院，分別是長老院、功德院、天一院。長老院為門中金丹長老所居之地，執掌傳度殿、掌籍殿。功德院為天都派批功之地，若立功勞，於此地批示。天一院為掌門弟子所居，總理派中事務，轄制遇真宮正殿，雖有總理之說，但各峰也只是礙於門中戒律，不敢違逆，實則貌合神離。
趙鶴年出得遇真宮，便往玉穹山而去。玉穹山方圓百里，其上便是執事、外事、執法三堂，此次便往執事堂而去。
還未進得殿門，便聽得裡面人聲嘈雜。執事堂掌管門職司、功考、府，乃是門晉升之階，若是職司在門尚好，若是分到派外偏遠之地做個執掌，那便是難以求得機緣，不僅不能去往傳功閣聽講，也不能結派其他弟子，每九年回來述職，參加門大考，無異於發配。
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