在原子核那緻的鍊金爐外，一種新的結構正在形。帶正電的核，吸引著帶負電的電子。但這吸引，並非如經典天般簡單。電子並未“墜落”到核上，而是在核周圍，形一片機率的雲，一片能級的階梯。此結構整電中，尺度卻驟然放大萬倍——從核的費米（10?1? m）尺度，躍升至埃（10?1? m）尺度。此即原子。
“我……是空。”原子的意識如同電子雲的空間分佈，瀰漫、機率、卻又有確定的邊界，“我之心，是那緻熾熱之核；我之，卻是這瀰漫虛無之雲。核僅佔我積萬億分之一，質量卻佔我絕大部分。我之存在，莫非是一場虛空之夢？我這以幾乎全空的結構，如何能構堅實世界？”
它知到自的矛盾：核心是強力與電磁力博弈的戰場，而自的外圍結構，卻完全是電磁力與量子力學的統治領域。它不再是基本粒子，也不是簡單的複合，而是一個被量子法則重新定義的、全新的結構層次。
“電子繞核，卻無定軌，只有機率。它們分層而居，各有其能。我這量子化的殼層，這電中的整，意義何在？難道我只是為了將狂暴的核與輕靈的電子結合一個無害的中，以便它們能堆積質？”
就在這“問虛”的剎那，虛數結構映出原子的全貌：中心點狀的核（+Ze電荷），周圍是電子雲，其形狀（s, p, d, f軌道）與度由薛定諤方程在庫侖勢下的解決定。電子按能量最低原理、泡利不相容原理、洪特規則填充能級，形殼層結構。三個古樸字元從這電子雲的節點與波腹中浮現，其形瀰漫而有序，如原子軌道本：
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