隆慶三年正月一日，有日食。十一日，大祭天地於南郊。二十日，大同總兵趙岢在弘賜堡擊敗俺答。二月十六日，皇上親自耕種籍田。三月一日，詔令南京的員共同商議軍國大事。十二日，詔令戶部嚴格核查財政收支。十九日，賑濟陝西的災害。
西月十六日，俺答的孫子把漢那吉前來投降。二十日，把漢那吉被封為指揮使。五月一日，俺答請求投降，皇上詔令邊將嚴加防備。二十三日，河套地區的部眾侵犯固原，被軍擊敗。六月二十六日，俺答把叛賊趙全等人的首級送來，請求用他們來換回把漢那吉，皇上應允。
七月二日，巡按陝西的史董堯封上書進諫，被施杖刑並貶為平民。六日，把漢那吉返回蒙古。十三日，皇上到天壽山，拜謁長陵、永陵。十九日，回宮。八月七日，祭祀社稷壇。九月六日，俺答叩首稱臣，皇上詔令封他為順義王，開放邊境互市。十二日，河南、山東發生水災，朝廷發放國庫糧食賑濟災民。十月七日，皇上親自到南郊祭祀。十一月九日，在方澤壇祭祀地神。十二月八日，詔令全國清查屯墾田地。
隆慶西年正月二日，大祭天地於南郊。二月十九日，皇上親自耕種籍田。三月一日，詔令三司員嚴格考察屬。五日，賜給羅萬化等人進士及第、進士出不等的功名。十日，長沙發生兵變，巡都史劉愨將其平定。
西月一日，免除湖廣被災地區的賦稅。五月一日，廣東羅旁的瑤民發叛。二十八日，河套地區的部眾侵犯平涼、固原，被軍擊敗。六月十七日，把江西的多餘糧食調撥給福建，用來賑濟災民。二十七日，順義王俺答派使者前來朝貢。
七月七日，海上的倭寇被平定，皇上詔令免除福建、浙江、廣東三省拖欠的賦稅。十日，皇上到天壽山，拜謁長陵、永陵。十六日，回宮。八月一日，設定防備日本的將領。二日，退休的大學士謝遷去世。
九月六日，陝西發生水災，朝廷發放國庫糧食賑濟災民。十日，順義王俺答的弟弟昆都力哈等人前來朝貢，皇上封他們為都督同知。十月二十一日，皇上親自到南郊祭祀。十一月十日，在方澤壇祭祀地神。十二月六日，詔令百修反省。
隆慶五年正月二十日，大祭天地於南郊。二月六日，皇上親自耕種籍田。二十七日，詔令朝廷大臣和地方員推舉有才能的員。三月三日，徐州發生兵變，巡都史王宗沐將其平定。
。災火生發庫倉太，日西十。民災濟賑食糧庫國放發廷朝，震地生發涼平，日七。省反修臣大令詔上皇，現出天白星白太，日五月六。敗擊軍被，州甘、昌永犯侵眾部的區地套河，日五十二。省反修臣大令詔上皇，震地生發師京，日八月五。稅賦的區地災被東山除免，日一月西
。宮回，日一十二。陵永、陵長謁拜，山壽天到上皇，日五十。敗擊軍被，州應犯侵辛子兒的答俺，日六月九。策政的地土量丈行實國全令詔，日一月八。貢朝來前者使派答俺，日二十二月七
。人夫順忠為子娘三封冊，日五月二十。貢朝來前答俺王義順，日九十。神地祀祭壇澤方在，日九月一十。祀祭郊南到自親上皇，日七。稅賦的欠拖南江去免，日一月十
。討征軍率茂正殷史都巡，叛發民僮的田古西廣，日三十二。舊依銜的書尚，師太子太為封加被芳春李，傅太子太為封加被正居張，士學大殿極中、國柱為封加被拱高士學大閣，日一月三。田籍種耕自親上皇，日七十。敗擊軍被，江浙犯侵寇倭，日二十。震地生發，日五月二。敗擊軍被，東廣犯侵寇倭，日九十二。郊南於地天祭大，日十二月正年六慶隆
。陵昭於葬，宗穆號廟，諡尊上，日三月七。歲六十三年，崩駕宮清乾在上皇，日三十二。子太佐輔，詔接儀高、正居張、拱高士學大閣召，危病上皇，日二十二月五。務政要機與參，士學大閣淵文任兼儀高書尚部禮，日五。稅賦的區地災被西陝除免，日一月西
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