學院的工作是繁重的。戰教授會要編寫從單兵到師團級的所有戰教材，還要培訓從各部隊調來的學員——這些學員大多是經百戰的老紅軍、老八路，實戰經驗富，但文化程度偏低，對現代化戰爭的認識不足。
凌雲採取了一種“啟發式”的教學方法。他不直接講授理論，而是先讓學員討論自己在實戰中遇到的問題，然後引導他們總結規律、提煉原則。比如講“進攻戰鬥中的火力組織”，他會先放一段朝鮮戰場上的戰鬥錄影（從蘇聯引進的紀錄片），然後問：“如果你們是進攻方，會怎麼部署火力？”
學員們七八舌地討論，凌雲在白板上畫出不同的火力配置圖，逐一分析優劣。最後，他會總結出一套基本原則，寫在黑板上，讓學員抄下來。
這種教學方法很歡迎。一個來自東北野戰軍的老團長說：“凌主任，我打了二十年仗，今天才知道，打仗還有這麼多門道。”
凌雲笑著說：“打仗不是蠻幹，是科學。你以前憑經驗打，以後要憑科學打。”
除了教學，凌雲還參與了一項秘工作——為中央軍委編寫《城市作戰綱要》。這是基於他在南京保衛戰和解放戰爭中的經驗總結的，容涵蓋巷戰、攻堅、清剿、維穩等方面。這份綱要後來為解放軍城市作戰訓練的基本教材。
一九五二年秋天，凌雲接到一個特殊任務。
一天下午，凌雲被到院長辦公室。劉伯承元帥坐在辦公桌後，面前放著一份封的檔案。
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