相比較而言，“止”相當於“本無分別智”，“觀”相當於“後得無分別智”，兩種智慧統一起來，既要靜坐禪定而“心真如”，又不能限於定坐，還要普濟眾生超俗世。這種止觀雙修的主張，對後世天台宗和禪宗都有著積極的影響。
《大乘起信論》在華夏佛教史上的影響是廣泛而深遠的，對天台宗、華嚴宗、禪宗、淨土宗的影響尤為顯著。天台宗的“真如緣起論”就借鑑了《起信論》中的“如來藏緣起論”，天台宗三祖慧思的《大乘止觀法門》自始至終都在闡釋《起信論》中的思想，如講到“心生萬”、“止觀法門”等觀點時，甚至直接引用《起信論》的一些原文來加以論證、闡述。《大乘起信論》對華嚴宗的影響就更顯著，華嚴宗的實際創始人法藏，就著有《大乘起信論義記》三卷和《大乘起信論義記別記》一卷，進一步闡釋並有所發揮《起信論》的思想觀點。華嚴宗直接繼承了《起信論》中的“法界緣起論”。華嚴宗五祖宗在《原人論》中直接吸取《起信論》的“本覺”觀，甚至直接引用《起信論》原文來論證“空”，可見其影響之大。禪宗和《起信論》都源於《楞伽經》，故《起信論》思想禪宗重視並接，是很自然的。禪宗五祖弘忍在《最上乘論》中提出一乘為宗，一乘就是一心，也就是《起信論》中的心如真門。六祖慧能也多吸收《起信論》思想，如主張“自識本心，自見本”，這裡的“本心”、“本”就是《起信論》中所說的“本覺”；他所主張的“真如是念之，念是真如之用”，就接近於《起信論》中的心真如門和心生滅門；他所提倡的“無念為宗”，就直接源於《起信論》的“若能觀察知心無念，即能隨順真如門”的思想；在修行理論上，他還吸取《起信論》中的“一行三昧”等。
禪宗北宗創始人神秀所提的“五方便門”中第一門就是“離念門”，所謂“離念”就是離卻妄念有念，迴歸到心真如、即本覺境地，這種思想完全取自《起信論》。又因《起信論》強調“發心修行”，故對後世的淨土宗也有一定影響。由於《大乘起信論》影響很大，故對它進行的註釋很多，就多達三十餘種，其中最通行的是唐代法藏的《大乘起信論義記》。唐代玄奘還曾將它譯為梵文，流傳到印度，可惜已佚失。
《大乘起信論》翻譯於南朝梁代，即出現於北魏太武帝燬佛典事件之後，故在這次劫難中不可能有它；但《起信論》出現在北周之前，且影響很大，故它在北周佛事件中難以倖免，屬在之列。所幸《起信論》流傳很廣，在江南仍能安然無恙地通行，所以它能得以穿越綿遠的時間隧道，完整地出現在當今世人面前。
《大乘起信論序》，揚州僧智愷作：夫起信論者，乃是至極大乘，甚深秘典，開示如理緣起之義。其旨淵弘寂而無相；其用廣大寬廓無邊。與凡聖為依，眾法之本；以其文深旨遠，信者至微；故於如來滅後六百餘年，諸道興，魔邪競扇，於佛正法，毀謗不停。時有一高德沙門，名曰馬鳴，深契大乘窮盡法，大悲融隨機應現，愍長迷故作斯論，盛隆三寶重興佛日，起信未久回邪正，大乘正典復顯於時，緣起深理更彰於後代；迷群異見者，舍執而歸依，暗類偏之黨，棄著而臻湊。自昔已來，久蘊西域，無傳東夏者。良以宣譯有時，故前梁武皇帝，遣聘中天竺伽陀國取經，並諸法師，遇值三藏拘蘭難陀，譯名真諦。其人小博採，備覽諸經，然於大乘偏深遠。時彼國王應即移遣，法師苦辭不免，便就泛舟，與瞿曇及多侍從，並送蘇合佛像來朝。而至未旬，便值侯景侵擾，法師秀採擁流，含珠未吐，慧日暫停，而還返。遂囑值京邑英賢、慧顯、智韶、智愷、曇振、慧旻，與假黃鉞大將軍太保蕭公，以大梁承聖三年，歲次癸酉九月十日，于衡州始興郡建興寺，敬請法師敷演大乘，闡揚秘典，示導迷徒。遂翻譯斯論一卷，以明論旨。《玄文》二十卷，《大品玄文》四卷，《十二因緣經》兩卷，《九識義章》兩卷。傳語人天竺國月支首那等，執筆人智愷等，首尾二年方訖。馬鳴衝旨，更曜於時，邪見之流，伏從正化。餘雖慨不見聖，慶遇玄旨，其幽宗，無已，不揆無聞，聊由題記，倘遇智者，賜垂改作。
《大乘起信論》原文，馬鳴菩薩造。梁西印度三藏法師，真諦譯。
歸命盡十方，最勝業遍知，無礙自在，救世大悲者；
及彼相，法真如海，無量功德藏；如實修行等。
。故斷不種佛，信正乘大起，執邪舍疑除，生眾令為
。分益利修勸、者五，分心信行修、者四，分釋解、者三，分義立、者二，分緣因、者一？五為何云。分五有說。說應故是，信衍訶起能法有：曰論
。分緣因說初
」。論造以所，緣因等是如有。故行修勸，益利示為、者八。故心信退不定必，前佛於生，便方念專示為、者七。故過心乘二、夫凡治對，觀止習修示為、者六。故網邪出，慢痴離遠，心其護善，障業惡消便方示為、者五。故心信習修，生眾微善令為、者四。故信退不任堪，法衍訶於，生眾善令為、者三。故謬不解正生眾諸令，義之本來如釋解為、者二。故敬恭、利名間世求非；樂竟究得，苦切一離生眾令為謂所：相總緣因、者一？八為何云。種八有緣因是「：曰答」？論此造而緣因何有「：曰問
