長安子醫學署立後，在李蘊歌的建議下，孟醫在醫學署設立識藥科、四診科、心理關懷科等三門學科。
三門學科並行四年，第一年通識，第二年分方向選修，第三年實踐，第四年跟師出診。每年兩次考核，考不過的留級，留級兩次仍不合格者勸退。
三門學科，各有分工。
識藥科的教習是孟醫舉薦的太醫院醫，姓方，四十出頭，掌管太醫院藥材庫，眼神毒辣，任何偽品、劣品都逃不過的眼睛。
所有學生須在兩年，辨識常用藥材三百味以上，不僅要知曉藥材名稱和長相，還要知道味歸經、功效主治、配伍忌、炮製方法。
聞問切四診科由李蘊歌與付二孃共同執教，付二孃主講診、問診，李蘊歌主講聞診、切診。兩人流上堂，一人講理論，一人帶實踐，兩相配合。
最特別的是心理關懷科。這門課是李蘊歌力主增設的，孟醫不僅全力支援，還幫著蒐羅了不前朝醫案中關於“志致病”的記載，供李蘊歌編教材。
這門課不管是教習還是學生，都要學習。
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