想通了這一點，治水的方略便定了下來。禹立刻召集了天下各個部落的百姓，開始了這場曠日持久的治水工程。他先士卒，永遠衝在最前面，拿著耒耜，帶著百姓開山鑿石，疏通河道。盛夏酷暑，他頂著烈日，在泥水裡奔波，皮被曬得黝黑皮；寒冬臘月，他踩著冰碴，在河道里施工，手腳都凍得裂開了口子，鮮首流。
《韓非子》裡記載，禹治水十三年（約公元前2131年-公元前2118年），“執耒臿，以為民先，無胈，脛不生”。他常年泡在泥水裡，上的汗都被磨了，手上腳上長滿了厚厚的老繭，走路一瘸一拐，後人把這種步伐，稱作”禹步”。
這十三年裡，他三次路過自己的家門口，都沒有進去看一眼。第一次路過家門，他聽到屋裡傳來了妻子塗山氏分娩的哭聲，還有嬰兒呱呱墜地的啼聲，那是他的兒子啟出生了。手下的人都勸他進去看看，他卻搖了搖頭，說洪水未平，百姓還在苦，我怎麼能因為家事，耽誤了治水的大事？轉便帶著隊伍離開了。
第二次路過家門，他的兒子啟己經會蹣跚走路了，在門口看到了他，著小手喊父親。他只是在門口揮了揮手，對著妻兒笑了笑，便又匆匆趕路，依舊沒有進門。
第三次路過家門，啟己經長了半大的孩子，跑出來拉著他的手，想把他拽進家裡。他了兒子的頭，說等父親治平了洪水，一定回家陪你。說完，便又轉奔赴了治水的前線。
十三年如一日，禹帶著百姓，鑿開了龍門，疏通了九河，打通了伊闕，治理了震澤。他順著地勢，把各大水系的河道一一疏通，讓氾濫的洪水，順著修好的河道，乖乖地流了大海。曾經被洪水淹沒的良田，重新了出來；曾經逃到山上的百姓，重新回到了平原；曾經一片汪洋的神州，重新變回了沃野千里。
至約公元前2118年，洪水，終於被治平了。正是：
鑿龍門，通九河，疏百川歸海。
。災離民萬救，患水平，川山定
：是正。人承繼的己自了為定他將，口絕不讚績功的禹對也舜。禹的大偉——”禹大”為他稱尊都，德恩的禹念不無，姓百下天
。流洪導疏為堵改，州神跋間年三十
。謀民萬為只心一，不終門家過三
。釀醞然悄，下之世盛平太這在正，局變的有未所前場一。基”下天公”的代數承傳了撼然悄更，民萬下天了救僅不，功之水治場這，到料曾未也己自他可。服誠悅心不無，侯諸下天，峰頂了到達然己，威的禹大，功水治
